为促进香港和南京两地教育、科技、人才等方面双向交流，南京市政府与香港理工大学签订《关于共建香港理工大学南京技术创新研究院框架协议》。此后，经过持续推进，香港理工大学南京技术创新研究院于2024年7月6日正式揭牌，围绕具身智能机器人、智能建造、人工智能物联网、创新眼药开发等关键技术研发及产业化方面，推进转化项目落地。

南京研究院依托港理大多位院士、教授，重点围绕数字经济、人工智能、生命与健康、绿色建设与环境等领域开展科技研发与成果转化，设有智能机器人与机电一体化研究中心、人工智能物联网创新研发中心、视觉健康创新研发中心、智能建造研究中心等四个中心。四个中心的牵头专家包括张丹教授、曹建农教授、李恒教授、杜志伟博士、林全博士等。

研究院将建设国际高端科技创新平台，沉淀一批自主可控的核心技术，形成一批新兴产业领域领军企业及科技创新人才队伍。目前，研究院还在围绕低空经济、智能制造装备、医疗健康机器人等项目拓展合作。